К особенностям процедуры религиоведческой экспертизы можно отнести наличие квалификационных требований к экспертам и возможность подачи заявления о проведении религиоведческой экспертизы по средствам веб-портала «электронного правительства» наряду с традиционной подачей через канцелярию уполномоченного органа. Также в нашей стране реализуется информационная система «Кибернадзор». В рамках которой на материалы религиозного содержания проводится религиоведческая экспертиза в целях оперативной блокировки экстремистского контента в сети интернет.